满足教学的需要，本中心自主开发平台了多项系统软件应用平台，例如：中药饮片企业商业智能分析与研究软件、基于云计算的中医药数据分析软件、基于UCSC的基因组数据分析平台、现代名老中医临床大数据抽取与清理方法研究与应用软件、中医养生知识推荐软件、智慧中医健康数据分析软件等系统。

与海泰合作开发“云医院”管理系统、医院信息管理系统软件、电子病历系统软件、移动医生查房管理软件、移动护理管理系统软件等实训软件。在适应专业学生进行实验和实践创新能力的带教方面，在相关课程的实验教学方面，中心建设以来获得第二届全国高校微课教学比赛三等奖、全国多媒体课件大赛奖、江苏省高校微课教学比赛一等奖等教学成果奖40项；教师自主开发创新性实验7个；承担省部级教学改革项目14项；中心的实验教师出版教材24部、其中实验教材4部，全部用于学生进入实验中心的教学和实验指导。